行,如前所述 分析按照之前

的报道进行。算法用于克隆性分析。使用版本包;参考文献)执行无监督共识聚类。簇分配签名的开发基于la算法。更多详细信息可以在补充方法中找到。m表达谱对于队列中包含的肺腺癌,先前已报道了有关从肿瘤中提取m文库制备测序在lluminaieq平台上)质量控制以及用于基因表达定量的后续数据处理的实验程序。有关肿瘤样本采集储存选择和提取的详细信息此前也已发表)。根据制造商的方案,使用lluminaumanveadhip对肿瘤进行基于阵列的表达谱分析。使用ffymetrix的enehipumanenerray对肺腺癌进行分析。 正如之前报道的那样 及其同事报道的肿瘤是使用 ffymetrix的和阵列进行分析的。队列的基因表达数据先前已存储在存储库中。肿瘤的基因表达数据已存放在存储库中。如前所述,使用ffymetrix的寡核苷酸微阵列伯利兹商业电子邮件列表对试验中的肿瘤进行了分析)并通过存储库进行访问。对于m表达数据的跨平台整合,每个基因的表达水平是通过平均相应的探针集得出的,并在每个数据集中进行标准化。缺失值被替换为。免疫组织化学根据标准方案,使用自动染色系统eicaondax;eicaicrosystems)对 组织切片μm厚)进行指定抗体染色参见补充表)。perio图 像分析工具箱perio;eicaicrosystems)用于对从扫描载玻 美国在线电子邮件列表 片获得的图像进行数字分析,如补充方法中所述。的分数是由两名胸部病理学家联合手动确定的,如前所述。细胞系增殖和鉴定细胞系由和德克萨斯大学西南医学中心;达拉斯,德克萨斯州)的inna博士和azdar博士建立,或从获得。将它们保存在;igmaifecience)中,并在的加湿室中补充谷氨酰胺热灭活ibco)和青霉素链霉素igmaifecience)。年至年间,使用短串联重复分析owerlex;romega)对至少个不同位点对所有细胞系进行了验证,并将结果与​​通过提供或由的inna博士提供的参考分析进行了比较。

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