超过的肿瘤才纳入分析 分析

前,细胞系在低血清中生长过夜,以减少培养.

前,细胞系在低血清中生长过夜,以减少培养条件导致的背景磷酸化。尽管当前的技术限制可能会对我们的数据集产生一定的偏差,例如,无法检测到太小或太大而无法通过/识别的胰蛋白酶磷酸肽,但我们仍然同时测量了大量位点的磷酸化状态(范围在到个非冗余位点/细胞系或肿瘤之间)。表和(可在线获取)显示了来自总共个细胞系和个肿瘤的选定磷酸酪氨酸谱。在超过种不同蛋白质上鉴定出个酪氨酸磷

酸化位点,极大地扩展了我们对酪氨酸激酶信号传导的

了解。当这些站点被hosphoitewwwphosphsiteorg查询时),已知磷酸化位点的综合资源(霍恩贝克等人,),以上显得新颖。这些数据已作为补充数据存放在ell网站和hosphoite中,并且数据集可通过巴哈马电话号码列表免费获取。非小细胞肺癌酪氨酸磷酸化作为筛选磷酸酪氨酸信号异常并根据磷酸肽数据集比较蛋白质的第一步,我们采用了半定量方法,使用磷酸肽分配的数量来近似样品中存在的磷酸肽的量。

粗略地说,从色谱柱洗脱的峰越宽检测到磷酸肽的频率就

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越高,因此样品中存在的磷酸肽就越多(参见图)。例 美国在线电子邮件列表 如,cet的磷酸肽数量与estern分析观察到的磷酸化cet蛋白水平的比较非常一致(吉尔克里斯特等人,,奥尔德等人,,齐拜洛夫等人,)(见图)。我们发现这种方法优于其他方法(例如母离子峰高),因为它使我们能够通过组合给定蛋白质上的所有位点来简化分析。接下来,我们根据蛋白质分类比较了细胞系和实体瘤中蛋白质酪氨酸磷酸化的分布。如图所示,蛋白激酶、粘附蛋白

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