下游分析包括对数据中检测到

和reakusion陈等人,)。的融合事.

和reakusion陈等人,)。的融合事件与预测、肿瘤克隆性估计以及属于ui分析套件一部分的多项分析进行交叉验证(迪斯等人,)。肿瘤克隆性估计包括识别肿瘤基因组中拷贝数中性基因组区域中体细胞位点的深读计数变异等位基因频率的核密度估计中的峰值。ui分析包括在七个独立突变机制类别的统计考虑下识别显着突变的基因,用于识别经常突变的功能域的邻近分析,以及将该数据集中发现的与

数据库中的进行比较 使用athcan温德尔等人

然后对癌症通路进行更集中的分析(兼久和后藤,金久等人,),特别是通路。为了识别假定的可药物靶标,通过识别具有非沉默突变、拷贝数扩增和/或高表达的基因加拿大 WhatsApp 号码列表来生成候选基因列表。由此产生的基因列表与当前在肺癌中使用或正在研究的“已知”药物基因相互作用列表相交叉。根据先前描述的方法,相同的候选基因列表还针对被认为是新药开发的潜在目标的基因列表进行了注释(霍普金斯和马夫,拉斯和兰佩尔,)。

扩展实验程序样本和数据采集用于全基因组测序的样

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本是从手术切除的新鲜冷冻肿瘤组织中鉴定出来的,这些组织已储存在 美国在线电子邮件列表 华盛顿大学医学院的组织采购中心。捐赠组织样本的患者已获得允许进行基因组研究的知情同意书。在启动该项目时还活着的患者重新同意进行全基因组测序。对于过期患者,已获得机构审查委员会的豁免。本研究仅选择符合以下纳入标准的样本;年龄>岁、知情同意、非小细胞肺癌组织学、基因组来源(邻近正常组织或外周血)的可用性以及无新辅助治疗。

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