标准冰冻切片、苏木精和伊红&染色的肿瘤组织，并进行组织学检查，以评估每个病例的肿瘤细胞结构、组织坏死百分比和其他显着的组织学特征（参见表）。肿瘤源自紧邻参考&切片的连续微米组织切片。对于每个病例，选择的样本在参考&切片中至少含有的肿瘤细胞核。llumina文库构建和测序描述的过程马迪斯等人，数及其映射在结构变异断点,bp内的配对均通过rossatch（版本）与组装的重叠群和
参考进行重新对齐 可接受的比对阈值是任一端≤
个未比对碱基、≤替换、≤插入缺失和rossatch分数>。需要支持的读取来跨越重叠群上的断点，比对到>断点两侧侧翼序列的个碱基，并且与上述最小比对标准的参考没开曼群岛 WhatsApp 号码列表有比对。支持读数分别在肿瘤和正常样本中制成表格，并对这些计数应用isher精确检验以确定每个变体的体细胞状态。对于通过所有其他标准视为体细胞的那些调用，将用于确定支持读取的相同方法应用于比对数据。正常样本中具有任何支持的读数的变体均被过滤掉，
作为潜在的种系变体或比对伪影 使用额外的过滤器来
删除序列，并根据支持捕获验证数据到跨越断点的组装重叠群的映射来 美国在线电子邮件列表 手动审查剩余的高置信度事件。使用肿瘤变异等位基因频率的核密度估计来鉴定肿瘤的克隆结构使用来自捕获验证数据的深度覆盖位点的突变等位基因频率来确定肿瘤克隆性估计。为了最大限度地减少覆盖率对等位基因频率估计的影响，该分析中仅包括正常和肿瘤验证数据中覆盖率>倍的突变。如果体细胞源自包含数据中确定的拷贝数改变的区域，则将其排除。
