个肿瘤中检测到的结构重排和拷贝

测序ircos图,与图和相关在数变化显示.

测序ircos图,与图和相关在数变化显示为ircos图。染色体首尾相连地环形排列,每条染色体的细胞带标记在外环上。内环显示从全基因组测序推断的拷贝数数据。在圆圈内,重排显示为弧线,其中紫色为染色体内事件,绿色为染色体间易位。下载pdf帮助处理pdf文件数据。所有个肺癌肿瘤样本的拷贝数变异的合成图,与图和图相关拷贝数估计值是使用我们内部的bamcna工具从参考基因组中,个连续kb窗口的全基因组中得出的(请参

阅扩展实验程序 对于种肺癌中的每一种,根据染

色体位置绘制了拷贝数差异值(肿瘤正常)。拷贝数扩增和缺失以“热图”模式着色(黄色、橙色和红色表示扩增,浅蓝色、中蓝色和深蓝色表示删除)。表意文字数据文件是从基因组浏览器建筑、五金、花园经销商电子邮件列表数据库中获得的,用于识别对应于每条染色体着丝粒的坐标。为了避免显示由重复区域中的作图偏差引起的伪影,将kb的侧翼添加到每个着丝粒区域,并将所得区域从分析中屏蔽(在图中以紫色表示)。每个面板(每个案例一个面板)的拷贝数差

异值绘制在y轴上,相对于x轴上的染色体位置 肿

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瘤和正常之间没有变化)在每个图中用水 美国在线电子邮件列表 平虚线标记。出于显示目的,修改了y轴刻度。首先,拷贝数增益的上限为,拷贝数损失的下限为。然后,将负值(缺失)的标度重新调整为与正值使用的标度对称(即,将至的标度调整为至)。肿瘤和正常之间没有变化)在每个图中用水平虚线标记。出于显示目的,修改了y轴刻度。首先,拷贝数增益的上限为,拷贝数损失的下限为。然后,将负值(缺失)的标度重新调整为与正值使用的

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