献:生产组负责序列数据的生产和处理,技术

开发组负责制定方法和故障排除,分析管道组.

开发组负责制定方法和故障排除,分析管道组负责开发自动化序列分析管道,小组负责开发管理样品和测序的工具和软件,系统小组负责提供测序和分析所需的基础设施和解决方案。我们感谢anieloboldt在肿瘤克隆分析方面提供的帮助,感谢ikeendl在通路分析方面提供的帮助,感谢osheck在手稿准备方面提供的帮助,以及oshuacichael在图形准备方面提供的帮助。我们还感谢华盛顿大学癌症基因组计划和斯特曼癌症中心的支持。入藏号本文报告的seq数据集的登录号正在等待中。在数据可用之前,读者可以问数据。

补充信息下载pdf帮助处理pdf文件数据。用于全基因组

测序的肿瘤样本的苏木精和曙红染色切片,与图相关下载pdf帮助处理pdf文件数据。全基因组测序ircos图,与图和相关在个肿瘤中检测到的结构重排和拷贝数变化显示为ircos图。染色体首尾相连地环形排列,每条染色体的细胞带标记在外环上。内环显示从全基因组测序推断的拷贝数数据。在圆圈内,重排显示为弧线,其中紫色为染色体内事件,绿色为染色体间易位。下载pdf帮助处理pdf文件数据。所有个肺癌肿瘤样本的拷贝数变异的合成图,与图和图以色列 WhatsApp 号码列表相关拷贝数估计值是使用我们内部的bamcna工具从参考基因组中,个连续kb窗口的全基因组中得出的(请参

阅扩展实验程序 对于种肺癌中的每一种,根据染

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色体位置绘制了拷贝数差异值(肿瘤正常)。拷 美国在线电子邮件列表 贝数扩增和缺失以“热图”模式着色(黄色、橙色和红色表示扩增,浅蓝色、中蓝色和深蓝色表示删除)。表意文字数据文件是从基因组浏览器数据库中获得的,用于识别对应于每条染色体着丝粒的坐标。为了避免显示由重复区域中的作图偏差引起的伪影,将kb的侧翼添加到每个着丝粒区域,并将所得区域从分析中屏蔽(在图中以紫色表示)。每个面板(每个案例一个面板)的拷贝数差

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