重排中保留了(,个中的个)。其中包括个蛋白质融合、个重复和个缺失。我们发现了个重排,它们融合了两个基因的,而不影响任一基因的蛋白质编码序列。我们测试的所有个基因融合体均通过和llumina测序进行了确认(参见扩展实验程序)(表)。就其大小而言,重排率最高的基因是(次重排/测序b)。两个病例存在框外反义融合(和orf),第三个病例存在框内缺失(图)。如肺鳞状细胞癌中所示,除了报道的突
变、纯合缺失和甲基化之外,重排代表了失活的另一种
机制。癌症基因组图谱研究网络,)。受预测无效批量短信罗马尼亚重排或截短重排影响的其他肺腺癌肿瘤抑制因子包括(kb删除,去除翻译起始位点)和(midexon重排)(图)。接下来我们关注潜在激活的激酶基因的框内重排。该分析发现了中的两个外显子缺失,该缺失先前在多形性胶质母细胞瘤中发现,但在肺腺癌中是新发现的,消除了由外显子和编码的末端的一部分(图、和)),包括与相互作用相关的残基(惠勒和多明,)和(røvdal等人,。
先前已在胶质母细胞瘤中发现了类似的末端缺失变异
体vb。埃克斯特兰德等人,)并已在细 美国在线电子邮件列表 胞和动物模型中显示出致癌性(曹等人,派恩斯等人,)。该肿瘤包含的第二个体细胞改变,即p突变,表明激活突变可能具有协同作用,或者存在独立的亚克隆激活突变。图缩略图gr图中新型肺腺癌框内缺失的鉴定显示完整标题查看大图图浏览器下载高分辨率图像下载()图缩略图igs图重排双端和拆分读段映射,与图相关显示完整标题查看大图图浏览器下载高分辨率图像下载()为了评估这种新型